Down Under

Hello!
Inmiddels ben ik al on the road op naar Darwin! Nu zit ik tussen Uluru en Alice Springs in in the Kings Canyon. Internet is zoo traag hier en superduur, je kunt geen foto’s uploaden, dus ik moet jullie helaas teleurstellen. Misschien in Alice Springs! De outback is echt unreal! van horizon to horizon alleen maar lege vlakte met soms struiken en gras. Overal zie je skeletten en autowrakken. Soms kleurt de lucht in de verte rood door een zandstorm. Ik heb nu nog 3 minuten over dus ik moet opschieten! Ik vertel jullie hopelijk meer in Alice springs! Groetssss!

Waar ik aan gewerkt heb in het kort en versimpeld! In het lab werkte ik aan Caulobacter crescentus, een non-pathogene α-proteobacterium. In het algemeen moeten bacteria zich snel aanpassen aan hun altijd veranderende omgeving en dit doen ze door constant externe condities te ‘meten’ en hun genexpressie te veranderen als reactie op externe signalen. Het betreft meestal genen die coderen voor eiwitten in het buiten membraan van de bacterie. In aanvulling op de veranderde genexpressie kunnen eiwitten in het buitenmembraan ook posttranslationeel gemodificeerd worden om een andere functie of activiteit te krijgen. Deze veranderingen als respons op een extern signaal worden ‘outer membrane remodelling’ genoemd.
Het doel van mijn studie was om een experimenteel systeem te ontwikkelen waar we de eiwitten kunnen identificeren en veranderingen in eiwit levels als gevolg van ‘outer membrane remodeling’ kunnen kwantificeren.
Dit heb ik gedaan door outer membrane eiwit profielen van pH gestressde cellen te analyseren met SDS-PAGE en Massa spectrometry. Een aantal eiwitten zijn geidificeerd en worden verder geanalyseerd. Na veel gedoe is t gelukt om een experimenteel systeem te ontwikkelen zodat in volgende studies SILAC (stable isotope labelling by amino acids in cell culture) gebruikt kan worden om de veranderingen in eiwit levels te kunnen meten en de regulatie van ‘outer membrane remodelling’ beter te begrijpen.

Ik zal verder niet op de details ingaan, heb ik nu niet zoveel zin in en jullie waarschijnlijk ook niet ☺

No worries en de groeten!

Voordat ik jullie eindelijk over den wetenschap ga vertellen, eerst een backpacker verhaaltje: Mijn backpacker leventje is weer begonnen en nu zit ik dus in een hostel in het centrum van Melbourne. Het blijkt de grootste backpackers van de wereld te zijn en t is inderdaad huge! 4 verdiepingen met slaapkamers. Gisteren ging het brandalarm af dus je kunt je voorstellen hoe dat eruit ziet als iedereen op de straat staat. Ik slaap in een 8 bed dorm en de eerste nacht was fantastisch: Na een BBQ en party ging ik rond 4 uur slapen. Ik had de nacht ervoor niet veel geslapen omdat ik m’n spullen ’s nachts aan het inpakken was voor de verhuizing naar het hostel. Voordat ik verder vertel over het wel o zo interessante fenomeen slaap (of het gebrek eraan), wil ik u graag eerst even wijzen op het comfort van mij bed: bovenste van stapelbed, dubieuze deken, geen kussen en wind van een ventilator die een plezierige bloemetjesgeur in neusgaten blaast en spieren aangenaam doet verstijven. Ok, op naar de slaap. 4.17: in slaap vallen; 5.04: licht aan, partyganger komt thuis; 6.21: licht aan, 3 lui ruimen hun spullen op en gaan ervandoor; 10.10: licht aan: housekeeping maakt de bedden op. Nice.

Continue Reading »

Zo das weer een tijdje geleden! Hoe is t daar in herfstige (?) Nederland? Ik heb intussen m’n ass eraf gewerkt, stage afgerond, gepartyd op parklife (en elsewhere), vrienden uitgezwaaid, ben op roadtrip geweest, verhuist naar een andere kamer, en inmiddels leef ik weer in een hostel. Kortom, genoeg om uren te vertellen. T enige is dat ik t in geschreven vorm jullie richting op moet slingeren en dat dit waarschijnlijk neer komt op 9 A4tjes. Nu ik niet echt te wachten zit op een carriere in de literatuur, zal ik jullie dit besparen. Waarschijnlijk geven julie t toch op na de eerste pagina, dus dat komt goed uit, kan ik die tijd mooi in Melbourne besteden aan voorbereidingen en laatste pleziertjes (Die 9 A4tjes + de rest van het boekwerk zal jullie volgend jaar wel in gesproken vorm achtervolgen :p) Voorbereidingen? Yes, ik vertrek vrijdag uit Melbourne. Dat is meer dan een week later dan ik gepland had, dus Continue Reading »